O‘zbekiston-Yaponiya Markazining Buxoro shahridagi vakolatxonasi 2007-yil 28-martda ochilgan. Markazda kun chiqar mamlakat madaniyati va tili bilan tanishtirishga qaratilgan quyidagi tadbirlar muntazam o‘tkazilib kelinmoqda.
Markazning asosiy vazifalaridan biri O‘zbekiston va Yaponiya xalqlari o‘rtasidagi o‘zaro anglashuvni mustahkamlashga ko‘maklashishdan iborat.
2023-yilda Markaz o‘zining 250 000 yubiley tashrif buyuruvchisini xursandchilik bilan kutib oldi.
O‘zbekiston-Yaponiya Markazining Buxoro shahridagi vakolatxonasi Buxoro davlat universiteti bosh binosi 3-qavatining chap qanotida joylashgan.